### PGS CATALOG SCORING FILE - see www.pgscatalog.org/downloads/#dl_ftp for additional information
## POLYGENIC SCORE (PGS) INFORMATION
# PGS ID = PGS000004
# Reported Trait = Breast Cancer
# Original Genome Build = GRCh37
# Number of Variants = 313
## SOURCE INFORMATION
# PGP ID = PGP000002
# Citation = Mavaddat N et al. Am J Hum Genet (2018). doi:10.1016/j.ajhg.2018.11.002
chr_name	chr_position	effect_allele	reference_allele	effect_weight	allelefrequency_effect
1	100880328	T	A	0.0373	0.4097
1	10566215	G	A	-0.0586	0.329
1	110198129	C	CAAA	0.0458	0.7755
1	114445880	A	G	0.0621	0.1664
1	118141492	C	A	0.0452	0.2657
1	120257110	C	T	0.0385	0.5309
1	121280613	G	A	0.0881	0.4053
1	121287994	G	A	-0.0673	0.106
1	145604302	CT	C	-0.0399	0.3515
1	149906413	C	T	0.0548	0.4017
1	155556971	A	G	0.0499	0.2302
1	168171052	C	CA	-0.068	0.1097
1	172328767	TA	T	-0.0435	0.3305
1	18807339	C	T	-0.0564	0.5145
1	201437832	T	C	0.0917	0.0559
1	202184600	T	C	-0.0065	0.3992
1	203770448	A	T	0.0498	0.2715
1	204502514	TTCTGAAACAGGG	T	-0.0321	0.8028
1	208076291	A	G	-0.0366	0.3337
1	217053815	G	T	0.0417	0.328
1	217220574	A	G	-0.044	0.2107
1	220671050	T	C	0.0418	0.2415
1	242034263	G	A	0.1428	0.0305
1	41380440	T	C	0.0426	0.6438
1	41389220	C	T	0.155	0.0169
1	46670206	T	TC	0.0447	0.2973
1	51467096	C	CT	0.0374	0.48
1	7917076	A	G	-0.0409	0.3899
1	88156923	A	G	0.0494	0.1487
1	88428199	A	C	-0.0387	0.2477
2	10138983	C	T	0.0603	0.116
2	121058254	G	A	-0.0334	0.7047
2	121089731	C	T	-0.0427	0.1943
2	121159205	A	G	-0.044	0.3527
2	121246568	C	T	0.0992	0.897
2	172974566	G	C	-0.0473	0.4743
2	174212910	G	A	0.0593	0.845
2	192381934	T	C	0.0316	0.8588
2	19315675	A	T	-0.0331	0.5599
2	202204741	C	T	-0.0492	0.721
2	217920769	T	G	-0.1318	0.5001
2	217955896	G	GA	-0.2016	0.0382
2	218292158	G	C	-0.0757	0.7309
2	218714845	A	G	-0.0431	0.3917
2	241388857	A	C	-0.1232	0.9772
2	25129473	G	A	-0.0427	0.4082
2	29179452	C	G	-0.0066	0.2287
2	29615233	C	T	-0.0427	0.2622
2	39699510	CT	C	-0.0402	0.4659
2	70172587	A	G	-0.0412	0.2787
2	88358825	C	G	0.0473	0.3081
3	141112859	C	CTT	0.0551	0.4149
3	172285237	A	G	0.0422	0.2131
3	189774456	T	C	-0.0478	0.2235
3	27353716	A	C	0.0748	0.5259
3	27388664	G	C	0.0502	0.2735
3	29294845	T	C	-0.1281	0.0163
3	30684907	T	C	0.0592	0.2975
3	46888198	C	T	-0.0806	0.1032
3	4742251	G	A	0.0616	0.3802
3	49709912	CT	C	-0.0367	0.2873
3	55970777	AT	A	-0.1195	0.0305
3	59373745	T	C	-0.0394	0.4294
3	63887449	TTG	T	0.0648	0.1297
3	71620370	G	T	-0.0374	0.6382
3	87037543	G	A	-0.0723	0.0921
3	99403877	A	G	-0.0376	0.4852
4	106069013	T	G	0.0471	0.2289
4	126752992	AAT	A	-0.0377	0.5167
4	143467195	T	C	-0.0569	0.1115
4	151218296	C	CATATTT	0.0388	0.6533
4	175842495	A	G	-0.0898	0.1161
4	175847436	A	C	0.0348	0.3433
4	187503758	T	A	0.0357	0.4471
4	38784633	T	G	0.0489	0.2493
4	84370124	TA	TAA	-0.0464	0.5324
4	89240476	A	G	0.0352	0.4395
4	92594859	T	TTCTTTC	-0.0407	0.4445
5	104300273	T	G	-0.0487	0.181
5	122478676	A	C	-0.0386	0.7448
5	122705244	T	C	0.0944	0.0306
5	1279790	T	C	0.0617	0.2592
5	1296255	AG	A	-0.0549	0.3072
5	131640536	G	A	0.0392	0.5427
5	132407058	T	C	-0.0388	0.245
5	1353077	C	T	0.1552	0.0121
5	158244083	T	C	-0.0677	0.5683
5	16231194	C	G	-0.0426	0.5594
5	169591460	C	T	0.0412	0.3345
5	173358154	A	G	0.0365	0.4074
5	176134882	C	T	0.0363	0.5422
5	2777029	A	G	0.0391	0.4139
5	32579616	T	TCA	0.0363	0.4844
5	345109	C	T	0.084	0.0544
5	44508264	GT	G	-0.1177	0.1265
5	44619502	G	A	-0.1101	0.1549
5	44649944	T	C	0.0492	0.601
5	44706498	G	A	0.0497	0.2481
5	44853593	C	G	-0.0336	0.3081
5	52679539	CA	C	0.0571	0.0998
5	55662540	CT	C	-0.0458	0.3631
5	55965167	T	C	0.0394	0.5576
5	56023083	G	T	0.1366	0.1583
5	56042972	T	C	0.0865	0.0521
5	56045081	C	T	-0.0564	0.1655
5	58241712	T	C	-0.0434	0.575
5	71965007	A	G	-0.041	0.2572
5	73234583	C	T	-0.0363	0.3213
5	77155397	G	GT	-0.0408	0.3466
5	79180995	GA	G	0.0328	0.1755
5	81512947	T	TA	-0.0598	0.2503
5	90789470	A	G	-0.0564	0.158
6	130341728	CT	C	0.0472	0.7116
6	13713366	C	G	-0.0553	0.5691
6	149595505	C	T	-0.0476	0.2061
6	151949806	C	A	0.0703	0.3083
6	151955914	G	A	0.1449	0.0713
6	152022664	C	CAAAAAAA	0.0137	0.6119
6	152023191	A	G	0.0626	0.3965
6	152055978	T	A	0.074	0.0627
6	152432902	T	C	0.0649	0.5146
6	16399557	T	C	-0.0373	0.3299
6	169006947	G	C	-0.0308	0.5202
6	170332621	C	T	0.0373	0.6158
6	18783140	A	G	0.0326	0.62
6	20537845	C	CA	-0.0391	0.4733
6	21923810	C	T	-0.0321	0.4303
6	27425644	C	G	-0.0737	0.0815
6	43227141	A	G	-0.064	0.0985
6	82263549	A	AAT	0.0477	0.4262
6	85912194	C	CAA	0.0762	0.0604
6	87803819	C	T	0.0383	0.277
7	101552440	A	G	-0.0568	0.1255
7	102481842	C	T	0.0418	0.3416
7	130656911	T	C	-0.0476	0.3734
7	130674481	A	G	0.0416	0.2971
7	139943702	C	CT	0.0582	0.5381
7	144048902	T	G	-0.0563	0.2284
7	21940960	G	A	-0.0467	0.3515
7	25569548	T	C	-0.0486	0.1667
7	28869017	A	G	-0.0572	0.1072
7	55192256	C	A	-0.0349	0.5497
7	91459189	ATT	A	0.0452	0.3286
7	94113799	C	T	0.0449	0.2792
7	98005235	A	G	-0.0467	0.1627
7	99948655	G	T	0.042	0.2109
8	102483100	C	T	0.0593	0.0967
8	106358620	T	A	-0.0745	0.1003
8	117209548	G	A	-0.0417	0.6445
8	120862186	G	A	0.0527	0.1318
8	124563705	C	T	0.0477	0.1458
8	124571581	A	G	0.034	0.4173
8	124739913	G	T	0.0466	0.3985
8	128213561	CA	C	-0.043	0.4153
8	128370949	G	C	0.0642	0.402
8	128372172	G	A	0.0597	0.5446
8	129199566	A	G	0.0615	0.1717
8	143669254	G	A	-0.0346	0.339
8	170692	C	T	0.0477	0.2227
8	17787610	C	CT	-0.0377	0.623
8	23447496	G	A	-0.0389	0.6487
8	23663653	A	C	0.0335	0.4032
8	29509616	C	A	-0.0601	0.6756
8	36858483	G	A	-0.076	0.182
8	76230943	G	A	0.0755	0.8282
8	76333056	T	C	0.1129	0.0878
8	76378165	T	G	-0.0391	0.3595
9	110303808	T	TAA	0.0797	0.2065
9	110837073	G	A	0.1158	0.063
9	110837176	T	C	0.0653	0.175
9	110849525	T	G	0.0153	0.5977
9	110885479	T	C	0.0877	0.6222
9	119313486	G	A	-0.0462	0.4087
9	129424719	G	A	-0.0382	0.4577
9	136146597	T	C	0.04	0.2727
9	21964882	C	CAAAA	0.055	0.3184
9	22041998	G	C	0.0289	0.1393
9	36928288	C	T	0.0249	0.5349
9	6880263	G	A	0.0348	0.2855
9	87782211	C	T	0.0361	0.5094
9	98362587	C	T	0.0576	0.094
10	114777670	T	C	0.0472	0.4631
10	115128491	C	T	-0.0592	0.7846
10	123095209	A	G	-0.0538	0.3269
10	123340107	G	A	0.1508	0.0656
10	123340431	G	GC	-0.2408	0.5963
10	123349324	T	A	-0.2609	0.0484
10	13892298	A	G	0.0371	0.4376
10	22032942	G	A	-0.058	0.7085
10	22477776	A	ACC	0.1687	0.0202
10	22861490	C	A	0.0875	0.937
10	38523626	A	C	0.0404	0.3698
10	5794652	G	A	0.047	0.2137
10	64299890	G	A	-0.1345	0.1603
10	64819996	T	G	0.0472	0.1958
10	71335574	T	C	-0.0404	0.3179
10	80851257	T	G	-0.0805	0.6172
10	80886726	G	A	0.0762	0.1631
10	95292187	C	CAA	-0.0512	0.8234
11	103614438	G	T	0.0147	0.6572
11	108267402	CA	C	-0.0022	0.4173
11	111696440	C	T	-0.0396	0.6221
11	116727936	T	A	-0.0423	0.2046
11	122966626	G	A	-0.0383	0.2922
11	129243417	G	T	-0.0543	0.862
11	129461016	G	A	0.0453	0.6016
11	18664241	G	T	0.0461	0.7293
11	1895708	A	C	-0.0762	0.3924
11	42844441	T	C	-0.0336	0.3279
11	433617	C	T	-0.0437	0.7969
11	44368892	A	G	0.0374	0.5495
11	46318032	G	C	-0.0748	0.0659
11	65553492	A	C	0.0425	0.1867
11	65572431	A	G	-0.0347	0.4886
11	69328130	T	A	-0.0423	0.213
11	69330983	A	G	0.1022	0.125
11	69331418	T	C	0.1782	0.0753
11	803017	G	A	0.0457	0.5167
12	103097887	T	C	0.0546	0.1175
12	111600134	T	G	-0.0442	0.3715
12	115108136	C	T	0.0465	0.2615
12	115796577	G	A	-0.0428	0.1959
12	115835836	C	T	-0.0813	0.4171
12	120832146	T	C	0.0516	0.1593
12	14413931	C	G	0.0484	0.2619
12	28149568	T	C	-0.062	0.117
12	28174817	T	C	-0.0856	0.2421
12	28347382	T	C	-0.0521	0.2153
12	29140260	A	G	0.0647	0.9126
12	293626	G	A	0.0401	0.3711
12	57146069	G	T	-0.0579	0.1037
12	70798355	T	A	0.0469	0.181
12	83064195	GA	G	0.0671	0.0992
12	85004551	T	C	0.0348	0.4955
12	96027759	G	A	-0.0867	0.2963
13	32839990	A	G	0.0424	0.0174
13	32972626	T	A	0.2687	0.0079
13	43501356	G	A	0.0517	0.8303
13	73806982	C	T	0.0345	0.3153
13	73960952	G	A	0.0399	0.7618
14	105213978	G	T	0.0399	0.4588
14	37128564	A	C	-0.0733	0.2122
14	37228504	T	C	0.039	0.4434
14	68660428	C	T	-0.0474	0.8345
14	68979835	C	T	-0.0911	0.2581
14	91751788	T	TC	0.038	0.6934
14	91841069	G	A	0.0513	0.3444
14	93070286	T	C	-0.0577	0.1709
15	100905819	C	A	-0.0608	0.11
15	46680811	A	C	-0.1973	0.0115
15	50694306	G	A	-0.0417	0.3446
15	66630569	A	G	-0.0369	0.6413
15	67457698	G	A	0.0782	0.0496
15	75750383	C	T	-0.0413	0.2604
15	91512267	T	G	-0.0589	0.1353
16	10706580	A	G	-0.074	0.0695
16	23007047	T	G	0.1218	0.0236
16	4008542	C	CAAAAA	-0.0329	0.8213
16	4106788	A	C	-0.03	0.2643
16	52538825	A	C	0.1147	0.2562
16	52599188	T	C	0.107	0.2406
16	53809123	T	C	-0.0704	0.4201
16	53861139	T	C	-0.0338	0.7604
16	53861592	A	G	-0.0337	0.3663
16	54682064	A	G	0.0477	0.485
16	6963972	G	C	0.0354	0.7835
16	80648296	G	A	0.0839	0.2303
16	85145977	C	T	-0.0211	0.4856
16	87086492	C	T	-0.0469	0.2586
17	29168077	T	G	-0.0568	0.2613
17	39251123	C	T	0.0799	0.0682
17	40127060	C	T	0.0174	0.057
17	40485239	T	G	-0.0571	0.0874
17	40744470	A	G	0.2017	0.0124
17	43212339	CT	C	0.0438	0.2284
17	44283858	A	G	-0.054	0.1895
17	53209774	C	A	-0.0793	0.3023
17	77781725	G	A	-0.0401	0.5038
18	11696613	T	C	-0.0381	0.1379
18	20634253	T	C	-0.0415	0.6403
18	24125857	C	T	0.0346	0.4214
18	24337424	G	C	0.0455	0.6205
18	24518050	A	AT	-0.0599	0.2773
18	25407513	G	C	0.0399	0.7126
18	29981526	A	G	-0.1058	0.0474
18	42411803	C	G	-0.0877	0.0717
18	42888797	C	T	-0.0542	0.3519
19	13249921	T	G	0.0956	0.0513
19	17393925	A	C	0.0378	0.2958
19	18569492	T	C	-0.0719	0.3481
19	19517054	CGGGCG	C	0.0437	0.3537
19	44283031	C	T	0.0619	0.3519
19	46166073	C	T	-0.036	0.6074
19	55816678	T	C	-0.0359	0.3626
20	11379842	C	T	0.0844	0.9483
20	41613706	G	C	0.0315	0.7928
20	52296849	A	G	0.044	0.24
20	5948227	A	G	0.076	0.0628
21	16364756	G	T	0.0646	0.1732
21	16566350	G	A	0.0595	0.0873
21	16574455	A	C	-0.0707	0.3167
21	47762932	A	G	0.0946	0.0355
22	19766137	T	C	-0.0367	0.3798
22	29121087	G	A	0.1839	0.0054
22	29135543	A	G	0.0654	0.087
22	29203724	T	C	0.1405	0.0209
22	29551872	G	A	-0.1716	0.9846
22	38583315	AAAAGAAAG	AAAAG	-0.0471	0.2805
22	39343916	A	T	0.0407	0.2541
22	40904707	C	CT	0.1148	0.1099
22	43433100	T	C	-0.06	0.1144
22	45319953	A	G	-0.0134	0.4166
22	46283297	A	G	0.0736	0.1117
